9月12日14时00分，上海市防汛信息中心发布黄浦江高潮位蓝色预警信号：受第14号台风“灿都”影响，预计9月13日17时10分黄浦江苏州河口最高潮位将达4.70米左右，市防汛指挥部要求各级防汛机构、沿江沿河各单位检查落实防范措施。
记者从上海地铁运营方获悉，各座车站共有“五道防线”防汛，当降雨量太大时，集水泵将自动报警自动排水。
上海地铁有关负责人介绍，目前，上海各地铁车站内都配有挡水板、阻水袋、集水泵等防汛设备。当出现大暴雨时，车站靠这些装备组成了“五道防线”。
在地面上，地铁出入口前有阻水沟。阻水沟连通排水管网，可以快速排走积水。这是第一道防线。当雨量过大，难以短时间排走时，就要靠第二道防线，每个出入口在设计时抬高了一定数量的台阶，防止积水倒灌进车站。
在入口处的第三道防线是防汛板。防汛板根据每个车站出入口专门定制，需要时放置在入口处。而阻水袋构成了第四道防线，阻水袋放置在防汛板后方，阻水袋起到了吸水作用，站台空档处万一有漏水，可以及时阻止雨水渗入。如果雨量实在太大，集水泵会自动报警，进行自动疏通排水，这是第五道防线。工作人员在17号线漕盈路地铁口放置防讯板。
上海地铁在台风来临前，正组织有关工作人员检查抢修设备，在地铁口放置防水挡板，另对车站、基地、线路附属设施和悬挂物紧固状态开展检查，防止因物体脱落、倾倒导致设施侵限、高空坠物、人员伤害事件的发生。
何种情况地铁会停运？上海地铁有关负责人称，当风力达到9级以上时地铁停运，影响较大的为线路地面、高架区段车站。
上海地铁提醒，请乘客关注天气变化和地铁应急信息发布，提前规划调整行程；在遇台风伴随的强降雨时，应尽量在高架站靠近站台中心区域候车，小心脚下积水、湿滑。一旦轨道交通因灾害天气限速、交路调整、列车停运等情况，切勿擅自拉车厢紧急拉手，请根据现场指引，积极配合。